La isla principal tiene tres terrenos geográficos: las llanuras costeras angostas, una meseta de piedra caliza con cuevas kársticas permeado y las montañas Haghier. Las montañas se elevan a 5.000 pies (1.525 m). La isla es un poco más de 80 millas (130 kilómetros) de largo de este a oeste y típicamente 18-22 millas (30-35 kilómetros) de norte a sur.
El clima es generalmente desierto tropical, con lluvias es ligero, de temporada (invierno) y más abundante en la tierra más alta en el interior que a lo largo de las tierras bajas costeras. La temporada del monzón trae vientos fuertes y de alta mar.
Socotra es considerada la "joya" de la biodiversidad en el mar Arábigo. El largo aislamiento geológico del archipiélago de Socotra y el intenso calor y la sequía se han combinado para crear una flora endémicas únicas y espectaculares. Las encuestas han revelado que más de un tercio de los 800 o más especies de plantas de Socotra se encuentran en ningún otro lugar. Los botánicos clasificar la flora de Socotra entre las diez islas flora más amenazadas del mundo. El archipiélago es un sitio de importancia mundial para la conservación de la biodiversidad y un posible centro para el ecoturismo.
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