Buena pregunta titee, acabo de hacer unas cuantas pruebas y me he dado cuenta que GE por defecto siempre superpone la capa mas reciente sobre las anteriores.
Tampoco he encontrado ningún método para dar prioridades a una capas sobre otras (como, por ejemplo en las configuraciones de impresion de microstation).
A mi se me ocurre que al momento de generar el kml/kmz que el orden de generación de los poligonos sea inverso al de jerarquia de visualización (vamos, que primero se generen los shapes de municipios y luego los de info de municipio).
Hola a Todos, estoy buscando un fichero kml o kmz que contenga todos las C.A., provincias y municipios de españa, para crear la capa en google maps. Lo máximo que he llegado a encontrar es el software del www.ine.es, el cual no he probado, pero que al parecer incluye ficheros .shp con esta información, y que después hay que convertir a kml. Sabeis si se puede conseguir este fichero .kml directamente???.