El avistamiento más espectacular que puede realizarse en el lugar es el de la ballena azul, que migra al área durante el verano del hemisferio sur.
"SabÃamos que se habÃan realizado avistamientos de ballenas azules en la bahÃa pero no la razón por la que vienen" dice Orizola. "Luego de estudiarlas exhaustivamente, los investigadores concluyeron que las ballenas usan Melimoyu como lugar para alimentarse luego de tener a sus crÃas."
En 2011 el MERI se asoció con la Universidad Austral de Chile y el Centro Ballena Azul. Desde entonces, han realizado investigaciones acústicas para entender mejor la forma en la cual estas criaturas amenazadas se comunican y cómo surcan las aguas.